]> code.communitydata.science - covid19.git/blob - keywords/src/wikidata_translations.py
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[covid19.git] / keywords / src / wikidata_translations.py
1 from wikidata_api_calls import run_sparql_query
2 from itertools import chain, islice
3 import csv
4 from json import JSONDecodeError
5 from os import path
6
7 class LabelData:
8     __slots__ = ['itemid','label','langcode','is_alt']
9
10     def __init__(self, wd_res, is_alt):
11         obj = wd_res.get('label',None)
12         self.label = obj.get('value',None)
13         self.langcode = obj.get('xml:lang',None)
14         self.itemid = wd_res.get('item',None).get('value',None)
15         self.is_alt = is_alt
16
17     def to_list(self):
18         return [self.itemid,
19                 self.label,
20                 self.langcode,
21                 self.is_alt]
22
23 def GetAllLabels(in_csvs, outfile, topNs):
24
25     def load_item_ids(in_csv, topN=5):
26         with open(in_csv,'r',newline='') as infile:
27             reader = list(csv.DictReader(infile))
28             for row in reader:
29                 if int(row['search_position']) < topN:
30                     yield row["itemid"]
31
32     ids = set(chain(* map(lambda in_csv, topN: load_item_ids(in_csv, topN), in_csvs, topNs)))
33     ids = ids.union(open("../resources/main_items.txt"))
34     
35     labeldata = GetItemLabels(ids)
36
37     with open(outfile, 'w', newline='') as of:
38         writer = csv.writer(of)
39         writer.writerow(LabelData.__slots__)
40         writer.writerows(map(LabelData.to_list,labeldata))
41
42     
43 def GetItemLabels(itemids):
44
45     def run_query_and_parse(query, is_alt):
46         results = run_sparql_query(query)
47         try:
48             jobj = results.json()
49
50             res = jobj.get('results',None)
51             if res is not None:
52                 res = res.get('bindings',None)
53             if res is None:
54                 raise requests.APIError(f"got invalid response from wikidata for {query % itemid}")
55
56             for info in res:
57                 yield LabelData(info, is_alt)
58
59         except JSONDecodeError as e:
60             print(e)
61             print(query)
62             
63     def prep_query(query, prop, itemids):
64         values = ' '.join(('wd:{0}'.format(id) for id in itemids))
65         return query.format(prop, values)
66     
67     base_query = """
68     SELECT DISTINCT ?item ?label WHERE {{
69     ?item {0} ?label;
70     VALUES ?item  {{ {1} }}
71     }}"""
72
73     # we can't get all the items at once. how about 100 at a time?
74     chunksize = 100
75     itemids = (id for id in itemids)
76     chunk = list(islice(itemids, chunksize))
77     calls = []
78     while len(chunk) > 0:
79         label_query = prep_query(base_query, "rdfs:label", chunk)
80         altLabel_query = prep_query(base_query, "skos:altLabel", chunk)
81         label_results = run_query_and_parse(label_query,  is_alt=False)
82         altLabel_results = run_query_and_parse(altLabel_query, is_alt=True)
83         calls.extend([label_results, altLabel_results])
84         chunk = list(islice(itemids, chunksize))
85
86     return chain(*calls)
87         
88
89 def find_new_output_file(output, i = 1):
90     if path.exists(output):
91         name, ext = path.splitext(output)
92
93         return find_new_output_file(f"{name}_{i}{ext}", i+1)
94     else:
95         return output
96
97 if __name__ == "__main__":
98     import argparse
99     parser = argparse.ArgumentParser("Use wikidata to find translations of terms")
100     parser.add_argument('inputs', type=str, nargs='+', help='one or more files to read. the inputs are generated by wikidata_search.py')
101     parser.add_argument('--topN', type=int, nargs='+', help='limit number of wikidata search results to use, can pass one arg for each source.')
102     parser.add_argument('--output', type=str, help='an output file. defaults to stdout',default=20)
103
104     args = parser.parse_args()
105
106     output = find_new_output_file(args.output)
107
108     GetAllLabels(args.inputs, output, topNs=args.topN)

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